Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD4P46934 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4P46934 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms