Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPHP41219 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPHP41219 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPHP41219 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPHP41219 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPHP41219 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPHP41219 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPHP41219 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms