Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJC1P36383 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJC1P36383 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJC1P36383 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJC1P36383 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJC1P36383 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms