Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN1P35523 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms