Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms