Protein–RNA interactions for Protein: P35219

CA8, Carbonic anhydrase-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA8P35219 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA8P35219 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA8P35219 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA8P35219 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA8P35219 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA8P35219 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA8P35219 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA8P35219 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CA8P35219 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA8P35219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA8P35219 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA8P35219 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA8P35219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA8P35219 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA8P35219 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA8P35219 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA8P35219 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA8P35219 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA8P35219 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA8P35219 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms