Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA4P35212 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA4P35212 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA4P35212 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA4P35212 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA4P35212 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms