Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKLRP30613 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKLRP30613 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKLRP30613 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKLRP30613 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKLRP30613 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKLRP30613 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKLRP30613 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms