Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP1P28562 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms