Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms