Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRR1P24046 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRR1P24046 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms