Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA1P20827 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms