Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5AP20339 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms