Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms