Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM21P19474 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms