Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLP19338 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLP19338 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLP19338 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLP19338 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLP19338 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLP19338 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCLP19338 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCLP19338 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLP19338 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLP19338 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLP19338 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms