Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPI1P17947 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPI1P17947 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms