Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN2P17706 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN2P17706 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms