Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB1P14653 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB1P14653 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms