Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VPREB1P12018 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms