Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms