Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA3P0C7M3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms