Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4AP04350 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms