Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX6O95503 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX6O95503 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX6O95503 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX6O95503 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX6O95503 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX6O95503 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX6O95503 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX6O95503 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX6O95503 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX6O95503 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX6O95503 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX6O95503 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms