Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDNEP1O95476 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1O95476 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms