Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT38O76015 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT38O76015 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT38O76015 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT38O76015 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT38O76015 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT38O76015 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT38O76015 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT38O76015 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT38O76015 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms