Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN2BO60939 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms