Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIAA0556O60303 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms