Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL13O43927 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms