Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP9O43818 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP9O43818 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP9O43818 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP9O43818 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP9O43818 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP9O43818 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP9O43818 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms