Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTIFO43310 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTIFO43310 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTIFO43310 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTIFO43310 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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