Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms