Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRTO14522 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
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