Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C0C1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C0C1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H7C0C1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H7C0C1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
H7C0C1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H7C0C1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C0C1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C0C1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C0C1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C0C1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C0C1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C0C1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms