Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms