Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4E1Z4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4E1Z4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4E1Z4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4E1Z4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4E1Z4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4E1Z4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B4E1Z4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4E1Z4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4E1Z4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4E1Z4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms