Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR42E2A6NKP2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms