Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERINC4A6NH21 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms