Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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