Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP16Q9Y5T5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms