Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP3Q9Y446 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms