Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms