Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms