Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms