Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FARSAQ9Y285 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms