Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNEQ9Y223 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms