Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNND2Q9UQB3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND2Q9UQB3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms