Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMYND8Q9ULU4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND8Q9ULU4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms