Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
INO80Q9ULG1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
INO80Q9ULG1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms