Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMFRQ9UKV5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms